《幻影纹章》在继承任天堂一代战棋RPG神作“火焰纹章”经典的玩法的基础上，更独创了以“战斗——收集姬——养成——战斗”为核心的全新战棋策略玩法，玩家要在游戏开始就考虑场地的大小，然后分析自己的计划，如何让自己最强的姬多参与战斗，而让辅助类的姬靠后不被伤害。
游戏采用回合制，玩家和怪物在同一场地中，按照回合数进行动作，两个相邻的角色就可以产生互动，恢复或发生战斗，战斗由角色本身的属性决定，所以，越好的姬属性越好，胜率也会越大。
在《幻影纹章》中，不同的角色都有各自不同的姬型，下面做简单介绍。
姬型一共分为6种，她们分别是王姬、命姬、攻姬、魔姬、守姬、匠姬（排名不分先后），它们都拥有各自不同的特点与能力。
王姬：全属性平衡，运成长高。
命姬：HP上限与成长提高，速与技上限与成长降低。
攻姬：力上限与成长提高，守上限与成长降低。
魔姬：魔上限与成长提高，精上限与成长降低。
守姬：守与精上限与成长提高，力与魔上限与成长降低。
匠姬：速与技上限与成长提高，守与精上限与成长降低。
游戏中的武器分为六类：剑、斧、枪、弓、铳、杖。
斧：近战职业，攻击力高但命中率较低，克制枪，但被剑克
剑：近战职业，命中回避高，克制斧，但被枪克
枪：近战职业，攻防平衡，克制剑，但被斧克
铳：远近皆可，攻击消耗生命值，HP与防御均较弱
弓：远程职业，但攻击力较低
杖：远近皆可，攻击力较低，可治疗队友
注：每个姬可以装备一件武具，必须跟自己的武器类型相同。所有武器类型的姬都可以装备盾。（在战斗中进行攻击，会提升所装备武具的经验值，累积到一定经验值会提升武具等级）
武器克制：近战武器克制关系：(斧→枪→剑→斧）
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